新疆昌吉国家农业高新技术产业示范区（以下简称农高区）是2022年4月经国务院批准成立的第二批国家级农高区（国函〔2022〕37号），是全国9家农高区之一，全疆唯一的国家农高区，前身是2002年成立的昌吉国家农业科技园区（以下简称农业园区）。昌吉农高区承担的国家战略任务是：全面实施创新驱动发展战略和乡村振兴战略，以干旱荒漠绿洲农业为主题，以棉花为主导产业，努力建设具有国际影响力的棉花科技创新高地、全国绿洲农业科技引领区、农业农村创新创业示范区、乡村产业融合发展样板区、“一带一路”农业开放发展试验区，在棉花全产业链科技创新、农业生物育种、绿洲农业高质量发展和一二三产业深度融合等方面探索示范，努力创造出可复制、可推广的经验。

昌吉国家农高区规划总面积约423平方公里，总体功能布局为“一城一镇两区”：一城即现代农业科技城（28.3平方公里）重点发展科技研发孵化、商贸物流、总部经济、信息金融、会展经济等产业；一镇即六工镇（81.65平方公里），着力打造乡村产业融合发展样板区和乡村振兴先行示范区；两区包括现代农业精深加工示范区（65.1平方公里）着力培育粮油、棉花和纺织服装、绿色有机果蔬、优质畜产品和生物制造、智能农业装备“4+2”产业集群，现代农业科技创新试验示范区（247.3平方公里）以“三个结合”（种养结合、农旅结合、一二三产融合）为中心，打造“三个基地”（新品种新技术试验示范基地、精深加工示范区的原料基地、生活物资供应基地）。

截止2022年末，共有市场主体4979家，其中企业2130家，有效期高新技术企业16家、科技型中小企业59家，州级以上农业产业化龙头企业29家，规上工业企业12家、专精特新企业8家（国家级小巨人1家）。农业园区在2013年、2019年两轮全国国家农业科技园区综合评估中均荣获优秀，成绩名列前茅；2016年成为丝绸之路经济带创新驱动发展试验区优先建设的重点园区，2020年被国务院认定为国家级双创示范基地。